MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002679	TCG	2	6	148290	148295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3002	NC_002679	CGGC	2	8	148310	148317	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3003	NC_002679	TCC	2	6	148341	148346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3004	NC_002679	AG	3	6	148484	148489	50 %	0 %	50 %	0 %	13488108
3005	NC_002679	TCG	2	6	148500	148505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3006	NC_002679	CTC	2	6	148514	148519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3007	NC_002679	GCC	2	6	148536	148541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3008	NC_002679	CCAG	2	8	148636	148643	25 %	0 %	25 %	50 %	13488108
3009	NC_002679	GGC	2	6	148721	148726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3010	NC_002679	TCT	3	9	148732	148740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488108
3011	NC_002679	AGGGG	2	10	148752	148761	20 %	0 %	80 %	0 %	13488108
3012	NC_002679	CTT	2	6	148790	148795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488108
3013	NC_002679	ACG	2	6	148797	148802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3014	NC_002679	GCTCCC	2	12	148933	148944	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	13488108
3015	NC_002679	TTG	2	6	149004	149009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488108
3016	NC_002679	CGA	2	6	149020	149025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3017	NC_002679	GAGC	2	8	149032	149039	25 %	0 %	50 %	25 %	13488108
3018	NC_002679	GGC	2	6	149071	149076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3019	NC_002679	CGC	2	6	149114	149119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3020	NC_002679	CGC	2	6	149143	149148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3021	NC_002679	CGT	2	6	149149	149154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3022	NC_002679	TCG	2	6	149169	149174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3023	NC_002679	TGC	2	6	149199	149204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3024	NC_002679	GGC	2	6	149240	149245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3025	NC_002679	CTT	2	6	149249	149254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488108
3026	NC_002679	CTT	2	6	149278	149283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488108
3027	NC_002679	CGC	3	9	149284	149292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3028	NC_002679	GTT	2	6	149345	149350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488108
3029	NC_002679	CG	3	6	149427	149432	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3030	NC_002679	CTC	2	6	149459	149464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3031	NC_002679	CG	3	6	149527	149532	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3032	NC_002679	GTC	2	6	149573	149578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3033	NC_002679	GTC	2	6	149723	149728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3034	NC_002679	GGC	2	6	149755	149760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3035	NC_002679	GC	3	6	149762	149767	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3036	NC_002679	GAA	2	6	149798	149803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488108
3037	NC_002679	CGG	2	6	149839	149844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3038	NC_002679	TGA	2	6	149854	149859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488108
3039	NC_002679	CAG	2	6	149903	149908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3040	NC_002679	CTC	2	6	149909	149914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3041	NC_002679	GAT	2	6	149954	149959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488108
3042	NC_002679	GCC	2	6	150071	150076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3043	NC_002679	CG	3	6	150098	150103	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3044	NC_002679	CCT	2	6	150139	150144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3045	NC_002679	TCC	2	6	150222	150227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3046	NC_002679	CGA	2	6	150229	150234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3047	NC_002679	CCG	2	6	150237	150242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3048	NC_002679	CGA	2	6	150254	150259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3049	NC_002679	CGC	2	6	150272	150277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3050	NC_002679	GCG	2	6	150310	150315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3051	NC_002679	TTC	2	6	150321	150326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488108
3052	NC_002679	GAA	2	6	150341	150346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488108
3053	NC_002679	GAC	2	6	150395	150400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3054	NC_002679	CTC	2	6	150422	150427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488108
3055	NC_002679	CGC	2	6	150469	150474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488108
3056	NC_002679	GC	3	6	150524	150529	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3057	NC_002679	CTGG	2	8	150587	150594	0 %	25 %	50 %	25 %	13488108
3058	NC_002679	CGA	2	6	150652	150657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488108
3059	NC_002679	GC	3	6	150687	150692	0 %	0 %	50 %	50 %	13488108
3060	NC_002679	GGC	2	6	150716	150721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488108
3061	NC_002679	CTT	2	6	150774	150779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488108
3062	NC_002679	GCC	2	6	150803	150808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_002679	TGGA	2	8	150816	150823	25 %	25 %	50 %	0 %	13488109
3064	NC_002679	CAT	2	6	150890	150895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488109
3065	NC_002679	CTCG	2	8	150959	150966	0 %	25 %	25 %	50 %	13488109
3066	NC_002679	TCG	2	6	150996	151001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3067	NC_002679	GGC	2	6	151067	151072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488109
3068	NC_002679	GCC	2	6	151246	151251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488109
3069	NC_002679	AG	3	6	151294	151299	50 %	0 %	50 %	0 %	13488109
3070	NC_002679	GC	3	6	151327	151332	0 %	0 %	50 %	50 %	13488109
3071	NC_002679	CGA	2	6	151345	151350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3072	NC_002679	CCG	2	6	151351	151356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488109
3073	NC_002679	GTC	2	6	151367	151372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3074	NC_002679	GCC	2	6	151504	151509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488109
3075	NC_002679	CAC	2	6	151520	151525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488109
3076	NC_002679	GGT	2	6	151537	151542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488109
3077	NC_002679	CTC	2	6	151595	151600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488109
3078	NC_002679	GATC	2	8	151612	151619	25 %	25 %	25 %	25 %	13488109
3079	NC_002679	CGCCC	2	10	151722	151731	0 %	0 %	20 %	80 %	13488109
3080	NC_002679	GCCG	2	8	151733	151740	0 %	0 %	50 %	50 %	13488109
3081	NC_002679	GAA	2	6	151745	151750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488109
3082	NC_002679	CTGC	2	8	151752	151759	0 %	25 %	25 %	50 %	13488109
3083	NC_002679	CGG	2	6	151787	151792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488109
3084	NC_002679	GGC	2	6	151855	151860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488109
3085	NC_002679	GC	3	6	151925	151930	0 %	0 %	50 %	50 %	13488109
3086	NC_002679	CAG	2	6	152000	152005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3087	NC_002679	GTC	2	6	152006	152011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3088	NC_002679	TCCC	2	8	152027	152034	0 %	25 %	0 %	75 %	13488109
3089	NC_002679	GTA	2	6	152075	152080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488109
3090	NC_002679	GTC	2	6	152082	152087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3091	NC_002679	GGTC	2	8	152095	152102	0 %	25 %	50 %	25 %	13488109
3092	NC_002679	GCC	3	9	152105	152113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488109
3093	NC_002679	TCT	2	6	152149	152154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488109
3094	NC_002679	CTTGGA	2	12	152156	152167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13488109
3095	NC_002679	CGA	2	6	152177	152182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3096	NC_002679	GATC	2	8	152225	152232	25 %	25 %	25 %	25 %	13488109
3097	NC_002679	GCTG	2	8	152317	152324	0 %	25 %	50 %	25 %	13488109
3098	NC_002679	TGC	2	6	152335	152340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3099	NC_002679	CGG	2	6	152377	152382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488109
3100	NC_002679	GAT	2	6	152444	152449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488109
3101	NC_002679	TTCG	2	8	152482	152489	0 %	50 %	25 %	25 %	13488109
3102	NC_002679	CGG	2	6	152490	152495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488109
3103	NC_002679	TCA	2	6	152509	152514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488109
3104	NC_002679	GAT	2	6	152531	152536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488109
3105	NC_002679	GAA	2	6	152555	152560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488109
3106	NC_002679	GAC	2	6	152562	152567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3107	NC_002679	CCT	2	6	152605	152610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488109
3108	NC_002679	TCC	2	6	152637	152642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488109
3109	NC_002679	CTG	2	6	152648	152653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3110	NC_002679	GTT	2	6	152669	152674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488109
3111	NC_002679	CAGGA	2	10	152756	152765	40 %	0 %	40 %	20 %	13488109
3112	NC_002679	AGA	2	6	152878	152883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488109
3113	NC_002679	CCA	2	6	152938	152943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488109
3114	NC_002679	GA	3	6	152991	152996	50 %	0 %	50 %	0 %	13488109
3115	NC_002679	GAC	2	6	153011	153016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3116	NC_002679	GTT	2	6	153020	153025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488109
3117	NC_002679	CGT	2	6	153040	153045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3118	NC_002679	TGT	2	6	153130	153135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488109
3119	NC_002679	CTT	2	6	153275	153280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488109
3120	NC_002679	TCCG	2	8	153414	153421	0 %	25 %	25 %	50 %	13488109
3121	NC_002679	G	6	6	153469	153474	0 %	0 %	100 %	0 %	13488109
3122	NC_002679	GTC	2	6	153602	153607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3123	NC_002679	GAA	2	6	153626	153631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488109
3124	NC_002679	TTG	2	6	153678	153683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488109
3125	NC_002679	TCG	2	6	153696	153701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3126	NC_002679	GGC	2	6	153720	153725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488109
3127	NC_002679	TCCG	2	8	153782	153789	0 %	25 %	25 %	50 %	13488109
3128	NC_002679	CGA	2	6	153817	153822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3129	NC_002679	G	6	6	153838	153843	0 %	0 %	100 %	0 %	13488109
3130	NC_002679	CGA	2	6	153868	153873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488109
3131	NC_002679	ACT	2	6	154013	154018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488110
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3134	NC_002679	TAG	2	6	154208	154213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488110
3135	NC_002679	TTCC	2	8	154217	154224	0 %	50 %	0 %	50 %	13488110
3136	NC_002679	CCGG	2	8	154264	154271	0 %	0 %	50 %	50 %	13488110
3137	NC_002679	TC	3	6	154319	154324	0 %	50 %	0 %	50 %	13488110
3138	NC_002679	GATCA	2	10	154419	154428	40 %	20 %	20 %	20 %	13488110
3139	NC_002679	GTC	2	6	154431	154436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488110
3140	NC_002679	GTC	2	6	154488	154493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488110
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3144	NC_002679	GCT	2	6	154568	154573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488110
3145	NC_002679	TG	4	8	154606	154613	0 %	50 %	50 %	0 %	13488110
3146	NC_002679	CGG	3	9	154635	154643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488110
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3148	NC_002679	GGGA	2	8	154699	154706	25 %	0 %	75 %	0 %	13488110
3149	NC_002679	CGC	2	6	154709	154714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488110
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3152	NC_002679	GCC	2	6	154803	154808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488110
3153	NC_002679	GGCCG	2	10	154810	154819	0 %	0 %	60 %	40 %	13488110
3154	NC_002679	GGC	2	6	154822	154827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488110
3155	NC_002679	TGT	2	6	154832	154837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488110
3156	NC_002679	TC	3	6	154871	154876	0 %	50 %	0 %	50 %	13488110
3157	NC_002679	CCG	2	6	154879	154884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488110
3158	NC_002679	CGT	2	6	154895	154900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488110
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3160	NC_002679	GCCGTG	2	12	155008	155019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13488110
3161	NC_002679	GGT	2	6	155028	155033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488110
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3165	NC_002679	GTG	3	9	155314	155322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488110
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3169	NC_002679	CG	3	6	155557	155562	0 %	0 %	50 %	50 %	13488111
3170	NC_002679	TCG	2	6	155590	155595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
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3174	NC_002679	CGT	2	6	155794	155799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
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3178	NC_002679	CGA	2	6	155896	155901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488111
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3196	NC_002679	GTC	2	6	156626	156631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
3197	NC_002679	GCT	2	6	156760	156765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
3198	NC_002679	TCG	3	9	156771	156779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
3199	NC_002679	GGC	2	6	156805	156810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488111
3200	NC_002679	CGT	2	6	156811	156816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488111
3201	NC_002679	GTTCG	2	10	156830	156839	0 %	40 %	40 %	20 %	13488111
3202	NC_002679	TCGCA	2	10	156892	156901	20 %	20 %	20 %	40 %	13488111
3203	NC_002679	TCGA	2	8	156958	156965	25 %	25 %	25 %	25 %	13488111
3204	NC_002679	CAA	2	6	157080	157085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3205	NC_002679	TTGC	2	8	157138	157145	0 %	50 %	25 %	25 %	13488229
3206	NC_002679	CGT	2	6	157242	157247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488229
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3214	NC_002679	CCGC	2	8	157750	157757	0 %	0 %	25 %	75 %	13488229
3215	NC_002679	CGAAC	2	10	157780	157789	40 %	0 %	20 %	40 %	13488229
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3219	NC_002679	AGAT	2	8	158224	158231	50 %	25 %	25 %	0 %	13488330
3220	NC_002679	CGA	2	6	158240	158245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488330
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3225	NC_002679	TCT	2	6	158368	158373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3226	NC_002679	TCA	2	6	158406	158411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3227	NC_002679	GCA	2	6	158431	158436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3228	NC_002679	TG	3	6	158445	158450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3229	NC_002679	TGC	2	6	158521	158526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488230
3230	NC_002679	ATG	2	6	158527	158532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488230
3231	NC_002679	CAT	2	6	158546	158551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488230
3232	NC_002679	GCC	2	6	158568	158573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488230
3233	NC_002679	GGC	2	6	158592	158597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
3234	NC_002679	AG	3	6	158829	158834	50 %	0 %	50 %	0 %	13488230
3235	NC_002679	GGA	2	6	158837	158842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488230
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3239	NC_002679	GA	3	6	159110	159115	50 %	0 %	50 %	0 %	13488230
3240	NC_002679	CAG	2	6	159198	159203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488230
3241	NC_002679	GCA	2	6	159246	159251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488230
3242	NC_002679	CGGAA	2	10	159255	159264	40 %	0 %	40 %	20 %	13488230
3243	NC_002679	TCCT	2	8	159313	159320	0 %	50 %	0 %	50 %	13488230
3244	NC_002679	GGCCGG	2	12	159323	159334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
3245	NC_002679	TGA	2	6	159364	159369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488230
3246	NC_002679	CGG	2	6	159439	159444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488230
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3248	NC_002679	CG	3	6	159494	159499	0 %	0 %	50 %	50 %	13488230
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3255	NC_002679	TGA	2	6	159834	159839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3258	NC_002679	CGG	2	6	160245	160250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_002679	T	6	6	160270	160275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3261	NC_002679	GCT	2	6	160328	160333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488112
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3272	NC_002679	TGC	2	6	160952	160957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488112
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3277	NC_002679	GCCG	2	8	161055	161062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3348	NC_002679	GATC	2	8	164023	164030	25 %	25 %	25 %	25 %	13488115
3349	NC_002679	GAA	2	6	164065	164070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488115
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3351	NC_002679	GCC	2	6	164104	164109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488115
3352	NC_002679	CGG	2	6	164152	164157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488115
3353	NC_002679	TCA	2	6	164175	164180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488115
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3356	NC_002679	CGT	2	6	164237	164242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3357	NC_002679	GC	3	6	164279	164284	0 %	0 %	50 %	50 %	13488116
3358	NC_002679	GCG	2	6	164287	164292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488116
3359	NC_002679	GATC	2	8	164363	164370	25 %	25 %	25 %	25 %	13488116
3360	NC_002679	CGA	2	6	164435	164440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488116
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3362	NC_002679	GTA	2	6	164481	164486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488116
3363	NC_002679	GTC	2	6	164580	164585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488116
3364	NC_002679	TGG	2	6	164642	164647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488116
3365	NC_002679	TGA	2	6	164684	164689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488116
3366	NC_002679	TCC	2	6	164782	164787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488116
3367	NC_002679	CGG	2	6	164798	164803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488116
3368	NC_002679	GC	3	6	164825	164830	0 %	0 %	50 %	50 %	13488116
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